企业是否具有自主知识产权，是企业通过高新技术企业进行认定的硬标准，包括发明、实用新型、产品设计和外形非简单改变、软件著作权、集成电路布图设计专有权、植物新品种等。
企业知识产权是衡量企业创新能力的重要指标，也是评价高新技术企业创新能力的重要指标，占30分。其中，技术进步（8分）、核心支撑作用（8分）、数量（8分）、获取方式（6分）。此外，知识产权的数量、技术水平和支撑功能也涉及高新技术企业申报科技成果转化的评价模块。也就是说，企业知识产权的数量和质量是高新技术企业应用和评价中60分权重的核心。
不同类型的知识产权可以用于不同的申报时间和不同的评分。发明专利、植物新品种、农作物品种、新药、中药保护品种、集成电路布图设计专有权等属于_类知识产权；实用新型、外观设计、软件著作权，等（商标除外）属于第二类知识产权。一类知识产权可重复用于高新技术企业申报，二类知识产权只能用于一次申报。
企业知识产权规划的核心工作是从研发项目的创新成果中提取具有专利申请和保护价值的技术创新点和方案。企业主要是通过解决日常生产技术问题，挖掘和应用已完成的研发项目成果，日常关注对竞争对手知识产权的跟踪和评估，规划知识产权的整合、规避和交叉许可。
根据国家支持的高新技术领域，企业的产品（服务）应分为以下八类：电子信息技术、生物与新药技术、航空航天技术、新材料技术、高新技术服务业、新能源与节能技术，资源环境技术、高新技术改造传统产业。
从事企业研发及相关技术创新活动的科技人员比例，不得低于当年企业职工总数的10%；企业应当提供名册及相关证明，名册应当载明：姓名，身份证号码、学历、专业、职称等（统计人员以与企业签订的劳动合同为准），证书包括：学历证书、职称证书（原则上只需提供部分证书，但有些企业需要提供所有人员的证书）。
申请发明专利和取得证书至少需要2-3年。对于时间有限的企业，可以考虑通过转让方式取得发明专利，办理转让手续的时间一般在一个月左右。本实用新型和设计的一般使用时间为6个月。一般来说，专利证书可以在同一年申请后取得。软件著作权的申请期限为2-3个月。一般的软件开发企业更适用。其他企业可酌情申请，但应确保与主业的关联性。
核心是“核心自主知识产权”最重要的特征。对于拟申请高新技术企业资质的企业，其使用的技术内容是企业开展业务的基础，而高新技术鉴定是对该技术内容的认定、鉴定和认证的过程。在这一过程中应注意保护企业的先进技术含量。
在我国现行的知识产权保护机制下，知识产权与技术秘密的关系是高新技术企业认定规则必须考虑的问题。根据我国知识产权保护的理念，一种可以认定为知识产权的技术内容，当事人可以选择两种方式：知识产权申请的公开保护和技术秘密的秘密保护。
在公示的情况下，由于需要知识产权证明，其他任何人都可以查阅和使用权利人披露其核心技术和原始内容的技术文件，只要付款，就可以使用。在选择成为技术秘密的情况下，虽然图像的经济效益受到损害，但它具有较高的隐蔽性，可以给权利人带来较大的预期价值。技术秘密作为一种商业秘密，受到立法的承认，在经济立法和刑事立法中受到保护。